QIAGEN CLC Genomics

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新型コロナウイルスの全ゲノム配列解析のためのNGSライブラリー調製試薬

216 views June 02, 2021

SARS-CoV-2ウイルスのターゲットNGS解析に最適なQIAseq SARS-CoV-2Primer Panelのご紹介をさせていただきます。...

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析1 インストールとライセンス認証

118 views June 02, 2021

QIAGEN CLC Genomics Workbenchのダウンロード、インストールおよびライセンス認証についてご説明いたします。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析3 ユーザーインターフェースの概略

65 views June 02, 2021

ファイル操作等のユーザーインターフェース、レファレンス配列の取得などについての説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析2 プラグインのインストール

92 views June 02, 2021

機能を追加するためのプラグインのインストールについての説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析4 使用する各種フォルダーの場所等の設定

102 views June 02, 2021

設定ファイル、一時ファイルを既定の場所から変更する場合の説明です。既定の場所で問題ない場合はこの動画は飛ばしていただいて問題ありません。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析5 SARS-CoV-2 解析ワークフローの実行

123 views June 02, 2021

リード配列のインポート、ワークフローの実行についての説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析6 解析結果の確認

93 views June 02, 2021

レポート、ゲノムブラウザー等で結果の確認を行います。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析7 系統樹の作成

109 views June 02, 2021

コンセンサス配列を用いてアライメントを行い、系統樹を作成する過程の説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析8 蛋白質の3次構造の表示

58 views June 02, 2021

蛋白質3次構造のデータベースを用い、変異の位置の蛋白質の3次構造を表示させる方法の説明です。

QIAGEN IPA

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QIAGEN IPA チュートリアル1 初期設定と終了

300 views September 25, 2020

最初に一度だけ必要な最低限必要な初期設定(使用でいるメモリーの最大値の設定)と終了の仕方の説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル2 入力データの準備

413 views September 23, 2020

入力データの形式、IPAで用意されているサンプルデータを利用する方法についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル3 テキストデータをエクセルに変換するときの注意点

205 views September 25, 2020

遺伝子名(Gene Symbol) にはSEPT7等、日付に似た名前があります。遺伝子名が入ったデータをエクセルに変換するときには注意が必要です。

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QIAGEN IPA チュートリアル4 データアップロード

260 views September 25, 2020

IPAにデータをアップロードする際、Excel形式でもアップロードできますが、ネットワークの負荷を減らすためタブ区切りのテキスト形式にしてアップロードする...

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QIAGEN IPA チュートリアル5 コアー解析の設定と実行

294 views September 25, 2020

IPAの主要な解析のセットであるコアー解析の設定、実行についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル6 コアー解析の結果のまとめ

289 views September 25, 2020

"コアー解析実行結果のまとめ(Summary)についての説明です。 "

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QIAGEN IPA チュートリアル7 既知のパスウエイ(Canonical Pathway)解析

481 views September 25, 2020

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivi...

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QIAGEN IPA チュートリアル8 上流制御因子の解析

323 views September 25, 2020

コアー解析の中でも使用される頻度の高い上流制御因子の解析です。

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QIAGEN IPA チュートリアル9 更なる上流因子の解析

202 views September 25, 2020

上流因子の更に上流の、マスター制御因子となっているかもしれない因子の解析(Causal networks)です。

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QIAGEN IPA チュートリアル10 下流解析

271 views September 25, 2020

下流解析(疾患、機能の解析)です。最初に下流の影響が四角形のヒートマップで表示されます。

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QIAGEN IPA チュートリアル11 Regulator Effects

130 views September 25, 2020

上流と下流を矛盾が少ないように繋いだネットワーク Regulator Effects です。薬剤の新たな疾患の治療薬候補が見つかるかもしれません。

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QIAGEN IPAチュートリアル12 実験結果の類似性検索 Analysis Match

140 views September 25, 2020

IPAには約65,000の差解析を行った実験結果のコアー解析を行っています。Analysis Match...

QIAGEN OmicSoft

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル1 Introduction

166 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの概要とQIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA)から利用するQIAGEN...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル2 QIAGEN IPAからの利用

167 views December 18, 2020

QIAGEN IPA から Land Explorer for IPAを利用する方法を説明させていただきます。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル3 ヒト組織の発現情報:GTEx

150 views December 18, 2020

QIAGEN IPA の全てのライセンスで利用できるヒトの組織の発現情報を提供している GTEx(The Genotype-Tissue...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル4 オンラインマニュアル

137 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの以下の2つのオンラインドキュメントについて簡単に解説いたします。 Array Suite Wiki...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル5 単一遺伝子の発現解析1

107 views December 18, 2020

ひとつの遺伝子を検索し、サンプルの絞り込み、グループ分けを行い、様々な形式で発現データの視覚化を行います。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル7 複数遺伝子の発現解析

108 views December 18, 2020

複数遺伝子による検索では、ヒートマップ等ひとつの遺伝子の検索とは異なるビューが利用できるようになります。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル9 融合遺伝子解析

141 views December 18, 2020

1遺伝子を指定しただけでも融合遺伝子の候補を表示することができ、またサンプル、遺伝子、変異の場所による様々な表示、サンプルの絞り込みが行えます。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル10 QIAGEN DiseaseLand

96 views December 18, 2020

がん以外の疾患を対象にした QIAGEN DiseaseLand では Disease vs. Normal, Responder vs....

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル11 Single Cell Land

114 views December 18, 2020

Single Cell Land は1細胞レベルの発現情報を集めたLandです。多細胞での発現情報では得られない情報が取得できる場合があります。

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QIAGEN IPA チュートリアル5 コアー解析の設定と実行

294 views September 25, 2020

IPAの主要な解析のセットであるコアー解析の設定、実行についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル6 コアー解析の結果のまとめ

289 views September 25, 2020

"コアー解析実行結果のまとめ(Summary)についての説明です。 "

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QIAGEN IPA チュートリアル7 既知のパスウエイ(Canonical Pathway)解析

481 views September 25, 2020

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivity Plot...

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QIAGEN IPA チュートリアル8 上流制御因子の解析

323 views September 25, 2020

コアー解析の中でも使用される頻度の高い上流制御因子の解析です。

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QIAGEN IPA チュートリアル9 更なる上流因子の解析

202 views September 25, 2020

上流因子の更に上流の、マスター制御因子となっているかもしれない因子の解析(Causal networks)です。

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QIAGEN IPA チュートリアル10 下流解析

271 views September 25, 2020

下流解析(疾患、機能の解析)です。最初に下流の影響が四角形のヒートマップで表示されます。

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QIAGEN IPA チュートリアル11 Regulator Effects

130 views September 25, 2020

上流と下流を矛盾が少ないように繋いだネットワーク Regulator Effects です。薬剤の新たな疾患の治療薬候補が見つかるかもしれません。

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QIAGEN IPAチュートリアル12 実験結果の類似性検索 Analysis Match

140 views September 25, 2020

IPAには約65,000の差解析を行った実験結果のコアー解析を行っています。Analysis Match により、自分の実験結果と類似した実験を探索することができます。