SARS-CoV-2ウイルスのターゲットNGS解析に最適なQIAseq SARS-CoV-2Primer Panelのご紹介をさせていただきます。...

QIAGEN CLC Genomics Workbenchのダウンロード、インストールおよびライセンス認証についてご説明いたします。

ファイル操作等のユーザーインターフェース、レファレンス配列の取得などについての説明です。

機能を追加するためのプラグインのインストールについての説明です。

設定ファイル、一時ファイルを既定の場所から変更する場合の説明です。既定の場所で問題ない場合はこの動画は飛ばしていただいて問題ありません。

リード配列のインポート、ワークフローの実行についての説明です。

レポート、ゲノムブラウザー等で結果の確認を行います。

コンセンサス配列を用いてアライメントを行い、系統樹を作成する過程の説明です。

蛋白質3次構造のデータベースを用い、変異の位置の蛋白質の3次構造を表示させる方法の説明です。

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivi...

最初に一度だけ必要な最低限必要な初期設定（使用でいるメモリーの最大値の設定）と終了の仕方の説明です。

入力データの形式、IPAで用意されているサンプルデータを利用する方法についての説明です。

遺伝子名（Gene Symbol） にはSEPT7等、日付に似た名前があります。遺伝子名が入ったデータをエクセルに変換するときには注意が必要です。

IPAにデータをアップロードする際、Excel形式でもアップロードできますが、ネットワークの負荷を減らすためタブ区切りのテキスト形式にしてアップロードする...

IPAの主要な解析のセットであるコアー解析の設定、実行についての説明です。

"コアー解析実行結果のまとめ（Summary）についての説明です。 "

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivi...

コアー解析の中でも使用される頻度の高い上流制御因子の解析です。

上流因子の更に上流の、マスター制御因子となっているかもしれない因子の解析（Causal networks）です。

下流解析（疾患、機能の解析）です。最初に下流の影響が四角形のヒートマップで表示されます。

上流と下流を矛盾が少ないように繋いだネットワーク Regulator Effects です。薬剤の新たな疾患の治療薬候補が見つかるかもしれません。

IPAには公開されている約110,000の差解析を行った実験のコアー解析の結果があります。Analysis Match...

IPAが保持している多くのコアー解析の結果について、個々の実験に記載されている注釈情報（メタデータ）をキーワードで検索し、興味のある実験の解析結果を閲覧す...

Single Cell Land は1細胞レベルの発現情報を集めたLandです。多細胞での発現情報では得られない情報が取得できる場合があります。

がん以外の疾患を対象にした QIAGEN DiseaseLand では Disease vs. Normal, Responder vs....

1遺伝子を指定しただけでも融合遺伝子の候補を表示することができ、またサンプル、遺伝子、変異の場所による様々な表示、サンプルの絞り込みが行えます。

QIAGEN...

複数遺伝子による検索では、ヒートマップ等ひとつの遺伝子の検索とは異なるビューが利用できるようになります。

マウスの疾患の Land...

ひとつの遺伝子を検索し、サンプルの絞り込み、グループ分けを行い、様々な形式で発現データの視覚化を行います。

QIAGEN OmicSoftの以下の２つのオンラインドキュメントについて簡単に解説いたします。 Array Suite Wiki...

QIAGEN IPA の全てのライセンスで利用できるヒトの組織の発現情報を提供している GTEx(The Genotype-Tissue...

QIAGEN IPA から Land Explorer for IPAを利用する方法を説明させていただきます。

QIAGEN OmicSoftの概要とQIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA)から利用するQIAGEN...

OmicSoft の概要と製品の種類についての説明です。

起動後、まず最初に利用するLand を選択します。

表示されているグラフのY軸は疾患の種類、喫煙歴等様々なメタデータで分類できます。

単一遺伝子の検索、および様々なメタデータでサンプルの絞り込みを行う方法を解説します。

Y軸を複数のメタデータで分類してグラフを表示する方法を解説します。

遺伝子を指定しないで複数のサンプルセット、実験間での比較を行う方法を解説します。

サンプル間で発現の差のある遺伝子リストを作成する場合等に必要なサンプルセットの作成方法を解説します。

グループのサンプルセットを用いて発現の差解析を行います。発現以外にCNV、スプライシング、変異の差解析も可能です。