QIAGEN CLC Genomics

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新型コロナウイルスの全ゲノム配列解析のためのNGSライブラリー調製試薬

773 views June 02, 2021

SARS-CoV-2ウイルスのターゲットNGS解析に最適なQIAseq SARS-CoV-2Primer Panelのご紹介をさせていただきます。...

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析1 インストールとライセンス認証

854 views June 02, 2021

QIAGEN CLC Genomics Workbenchのダウンロード、インストールおよびライセンス認証についてご説明いたします。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析3 ユーザーインターフェースの概略

447 views June 02, 2021

ファイル操作等のユーザーインターフェース、レファレンス配列の取得などについての説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析2 プラグインのインストール

518 views June 02, 2021

機能を追加するためのプラグインのインストールについての説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析4 使用する各種フォルダーの場所等の設定

489 views June 02, 2021

設定ファイル、一時ファイルを既定の場所から変更する場合の説明です。既定の場所で問題ない場合はこの動画は飛ばしていただいて問題ありません。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析5 SARS-CoV-2 解析ワークフローの実行

710 views June 02, 2021

リード配列のインポート、ワークフローの実行についての説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析6 解析結果の確認

737 views June 02, 2021

レポート、ゲノムブラウザー等で結果の確認を行います。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析7 系統樹の作成

584 views June 02, 2021

コンセンサス配列を用いてアライメントを行い、系統樹を作成する過程の説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析8 蛋白質の3次構造の表示

318 views June 02, 2021

蛋白質3次構造のデータベースを用い、変異の位置の蛋白質の3次構造を表示させる方法の説明です。

QIAGEN IPA

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07. QIAGEN IPAチュートリアル7 パスウエイ解析

166 views February 13, 2022

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivi...

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QIAGEN IPA チュートリアル1 初期設定と終了

1,349 views January 22, 2024

最初に一度だけ必要な最低限必要な初期設定(使用でいるメモリーの最大値の設定)と終了の仕方の説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル2 入力データの準備

1,866 views January 22, 2024

入力データの形式、IPAで用意されているサンプルデータを利用する方法についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル3 テキストデータをエクセルに変換するときの注意点

839 views January 22, 2024

遺伝子名(Gene Symbol) にはSEPT7等、日付に似た名前があります。遺伝子名が入ったデータをエクセルに変換するときには注意が必要です。

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QIAGEN IPA チュートリアル4 データアップロード

1,116 views January 22, 2024

IPAにデータをアップロードする際、Excel形式でもアップロードできますが、ネットワークの負荷を減らすためタブ区切りのテキスト形式にしてアップロードする...

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QIAGEN IPA チュートリアル5 コアー解析の設定と実行

1,291 views January 22, 2024

IPAの主要な解析のセットであるコアー解析の設定、実行についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル6 コアー解析の結果のまとめ

1,050 views January 22, 2024

"コアー解析実行結果のまとめ(Summary)についての説明です。 "

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QIAGEN IPAチュートリアル7 パスウエイ解析

2,071 views January 22, 2024

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivi...

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QIAGEN IPA チュートリアル8 上流制御因子の解析

1,224 views January 22, 2024

コアー解析の中でも使用される頻度の高い上流制御因子の解析です。

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QIAGEN IPA チュートリアル9 更なる上流因子の解析

746 views January 22, 2024

上流因子の更に上流の、マスター制御因子となっているかもしれない因子の解析(Causal networks)です。

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QIAGEN IPA チュートリアル10 下流解析

754 views January 22, 2024

下流解析(疾患、機能の解析)です。最初に下流の影響が四角形のヒートマップで表示されます。

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QIAGEN IPA チュートリアル11 Regulator Effects

531 views January 22, 2024

上流と下流を矛盾が少ないように繋いだネットワーク Regulator Effects です。薬剤の新たな疾患の治療薬候補が見つかるかもしれません。

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QIAGEN IPAチュートリアル12 実験結果の類似性検索 Analysis Match

552 views January 22, 2024

IPAには公開されている約110,000の差解析を行った実験のコアー解析の結果があります。Analysis Match...

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QIAGEN IPA チュートリアル13 プロジェクト検索

333 views January 19, 2024

IPAが保持している多くのコアー解析の結果について、個々の実験に記載されている注釈情報(メタデータ)をキーワードで検索し、興味のある実験の解析結果を閲覧す...

QIAGEN OmicSoft Land Explorer

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル11 Single Cell Land

286 views December 18, 2020

Single Cell Land は1細胞レベルの発現情報を集めたLandです。多細胞での発現情報では得られない情報が取得できる場合があります。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル10 QIAGEN DiseaseLand

224 views December 18, 2020

がん以外の疾患を対象にした QIAGEN DiseaseLand では Disease vs. Normal, Responder vs....

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル9 融合遺伝子解析

277 views December 18, 2020

1遺伝子を指定しただけでも融合遺伝子の候補を表示することができ、またサンプル、遺伝子、変異の場所による様々な表示、サンプルの絞り込みが行えます。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル7 複数遺伝子の発現解析

245 views December 18, 2020

複数遺伝子による検索では、ヒートマップ等ひとつの遺伝子の検索とは異なるビューが利用できるようになります。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル5 単一遺伝子の発現解析1

249 views December 18, 2020

ひとつの遺伝子を検索し、サンプルの絞り込み、グループ分けを行い、様々な形式で発現データの視覚化を行います。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル4 オンラインマニュアル

304 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの以下の2つのオンラインドキュメントについて簡単に解説いたします。 Array Suite Wiki...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル3 ヒト組織の発現情報:GTEx

288 views December 18, 2020

QIAGEN IPA の全てのライセンスで利用できるヒトの組織の発現情報を提供している GTEx(The Genotype-Tissue...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル2 QIAGEN IPAからの利用

341 views December 18, 2020

QIAGEN IPA から Land Explorer for IPAを利用する方法を説明させていただきます。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer for IPA チュートリアル1 Introduction

419 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの概要とQIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA)から利用するQIAGEN...

QIAGEN OmicSoft

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01. QIAGEN OmicSoft チュートリアル1 概要

160 views May 02, 2023

OmicSoft の概要と製品の種類についての説明です。

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02. QIAGEN OmicSoftチュートリアル2 起動と Land の選択

138 views May 02, 2023

起動後、まず最初に利用するLand を選択します。

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03. QIAGEN OmicSoftチュートリアル3 グループ分け (Y軸の分類)

132 views May 02, 2023

表示されているグラフのY軸は疾患の種類、喫煙歴等様々なメタデータで分類できます。

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04. QIAGEN OmicSoftチュートリアル4 遺伝子の検索、サンプルの絞り込み

124 views May 02, 2023

単一遺伝子の検索、および様々なメタデータでサンプルの絞り込みを行う方法を解説します。

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05. QIAGEN OmicSoftチュートリアル5 複数のメタデータによる分類

96 views May 01, 2023

Y軸を複数のメタデータで分類してグラフを表示する方法を解説します。

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06. QIAGEN OmicSoftチュートリアル6 比較解析

75 views April 30, 2023

遺伝子を指定しないで複数のサンプルセット、実験間での比較を行う方法を解説します。

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07. QIAGEN OmicSoftチュートリアル7 サンプルセットの作成

181 views April 29, 2023

サンプル間で発現の差のある遺伝子リストを作成する場合等に必要なサンプルセットの作成方法を解説します。

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08. QIAGEN OmicSoftチュートリアル8 発現の差解析

81 views April 28, 2023

グループのサンプルセットを用いて発現の差解析を行います。発現以外にCNV、スプライシング、変異の差解析も可能です。

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01. QIAGEN OmicSoft チュートリアル1 概要

160 views May 02, 2023

OmicSoft の概要と製品の種類についての説明です。

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02. QIAGEN OmicSoftチュートリアル2 起動と Land の選択

138 views May 02, 2023

起動後、まず最初に利用するLand を選択します。

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03. QIAGEN OmicSoftチュートリアル3 グループ分け (Y軸の分類)

132 views May 02, 2023

表示されているグラフのY軸は疾患の種類、喫煙歴等様々なメタデータで分類できます。

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04. QIAGEN OmicSoftチュートリアル4 遺伝子の検索、サンプルの絞り込み

124 views May 02, 2023

単一遺伝子の検索、および様々なメタデータでサンプルの絞り込みを行う方法を解説します。

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05. QIAGEN OmicSoftチュートリアル5 複数のメタデータによる分類

96 views May 01, 2023

Y軸を複数のメタデータで分類してグラフを表示する方法を解説します。

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06. QIAGEN OmicSoftチュートリアル6 比較解析

75 views April 30, 2023

遺伝子を指定しないで複数のサンプルセット、実験間での比較を行う方法を解説します。

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07. QIAGEN OmicSoftチュートリアル7 サンプルセットの作成

181 views April 29, 2023

サンプル間で発現の差のある遺伝子リストを作成する場合等に必要なサンプルセットの作成方法を解説します。

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08. QIAGEN OmicSoftチュートリアル8 発現の差解析

81 views April 28, 2023

グループのサンプルセットを用いて発現の差解析を行います。発現以外にCNV、スプライシング、変異の差解析も可能です。

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07. QIAGEN IPAチュートリアル7 パスウエイ解析

166 views February 13, 2022

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivity Plot...

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析8 蛋白質の3次構造の表示

318 views June 02, 2021

蛋白質3次構造のデータベースを用い、変異の位置の蛋白質の3次構造を表示させる方法の説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析7 系統樹の作成

584 views June 02, 2021

コンセンサス配列を用いてアライメントを行い、系統樹を作成する過程の説明です。

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QIAGEN CLC Genomics Workbenchによる解析6 解析結果の確認

737 views June 02, 2021

レポート、ゲノムブラウザー等で結果の確認を行います。