QIAGEN IPA

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QIAGEN IPA チュートリアル1 初期設定と終了

144 views September 25, 2020

最初に一度だけ必要な最低限必要な初期設定(使用でいるメモリーの最大値の設定)と終了の仕方の説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル2 入力データの準備

189 views September 23, 2020

入力データの形式、IPAで用意されているサンプルデータを利用する方法についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル3 テキストデータをエクセルに変換するときの注意点

98 views September 25, 2020

遺伝子名(Gene Symbol) にはSEPT7等、日付に似た名前があります。遺伝子名が入ったデータをエクセルに変換するときには注意が必要です。

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QIAGEN IPA チュートリアル4 データアップロード

108 views September 25, 2020

IPAにデータをアップロードする際、Excel形式でもアップロードできますが、ネットワークの負荷を減らすためタブ区切りのテキスト形式にしてアップロードする...

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QIAGEN IPA チュートリアル5 コアー解析の設定と実行

129 views September 25, 2020

IPAの主要な解析のセットであるコアー解析の設定、実行についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル6 コアー解析の結果のまとめ

134 views September 25, 2020

"コアー解析実行結果のまとめ(Summary)についての説明です。 "

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QIAGEN IPA チュートリアル7 既知のパスウエイ(Canonical Pathway)解析

183 views September 25, 2020

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivi...

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QIAGEN IPA チュートリアル8 上流制御因子の解析

120 views September 25, 2020

コアー解析の中でも使用される頻度の高い上流制御因子の解析です。

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QIAGEN IPA チュートリアル9 更なる上流因子の解析

81 views September 25, 2020

上流因子の更に上流の、マスター制御因子となっているかもしれない因子の解析(Causal networks)です。

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QIAGEN IPA チュートリアル10 下流解析

178 views September 25, 2020

下流解析(疾患、機能の解析)です。最初に下流の影響が四角形のヒートマップで表示されます。

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QIAGEN IPA チュートリアル11 Regulator Effects

58 views September 25, 2020

上流と下流を矛盾が少ないように繋いだネットワーク Regulator Effects です。薬剤の新たな疾患の治療薬候補が見つかるかもしれません。

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QIAGEN IPAチュートリアル12 実験結果の類似性検索 Analysis Match

87 views September 25, 2020

IPAには約65,000の差解析を行った実験結果のコアー解析を行っています。Analysis Match...

QIAGEN OmicSoft

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル1 概要

71 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの概要とWebブラウザーから利用するQIAGEN OmicSoft Land Explorerについてご説明いたします。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル2 QIAGEN IPAからの利用

71 views December 18, 2020

QIAGEN IPA から Land Explorer を利用する方法を説明させていただきます。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル3 ヒト組織の発現情報:GTEx

72 views December 18, 2020

QIAGEN IPA の全てのライセンスで利用できるヒトの組織の発現情報を提供している GTEx(The Genotype-Tissue...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル4 オンラインドキュメント

44 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの以下の2つのオンラインドキュメントについて簡単に解説いたします。 Array Suite Wiki...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル5 単一遺伝子の発現解析1

37 views December 18, 2020

ひとつの遺伝子を検索し、サンプルの絞り込み、グループ分けを行い、様々な形式で発現データの視覚化を行います。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル7 複数遺伝子の発現解析

43 views December 18, 2020

複数遺伝子による検索では、ヒートマップ等ひとつの遺伝子の検索とは異なるビューが利用できるようになります。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル9 融合遺伝子解析

59 views December 18, 2020

1遺伝子を指定しただけでも融合遺伝子の候補を表示することができ、またサンプル、遺伝子、変異の場所による様々な表示、サンプルの絞り込みが行えます。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル10 QIAGEN DiseaseLand

44 views December 18, 2020

がん以外の疾患を対象にした QIAGEN DiseaseLand では Disease vs. Normal, Responder vs....

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル11 Single Cell Lands

40 views December 18, 2020

Single Cell Land は1細胞レベルの発現情報を集めたLandです。多細胞での発現情報では得られない情報が取得できる場合があります。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル1 概要

71 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの概要とWebブラウザーから利用するQIAGEN OmicSoft Land Explorerについてご説明いたします。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル2 QIAGEN IPAからの利用

71 views December 18, 2020

QIAGEN IPA から Land Explorer を利用する方法を説明させていただきます。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル3 ヒト組織の発現情報:GTEx

72 views December 18, 2020

QIAGEN IPA の全てのライセンスで利用できるヒトの組織の発現情報を提供している GTEx(The Genotype-Tissue Expression...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル4 オンラインドキュメント

44 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの以下の2つのオンラインドキュメントについて簡単に解説いたします。 Array Suite Wiki...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル5 単一遺伝子の発現解析1

37 views December 18, 2020

ひとつの遺伝子を検索し、サンプルの絞り込み、グループ分けを行い、様々な形式で発現データの視覚化を行います。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル7 複数遺伝子の発現解析

43 views December 18, 2020

複数遺伝子による検索では、ヒートマップ等ひとつの遺伝子の検索とは異なるビューが利用できるようになります。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル8 変異解析

34 views December 18, 2020

QIAGEN OmicSoftの変異解析の結果はオミックデータ解析という発現、変異、コピー数等の実験結果のデータに基づいた表示を取り入れることにより、多様な視覚化が可能になります。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル9 融合遺伝子解析

59 views December 18, 2020

1遺伝子を指定しただけでも融合遺伝子の候補を表示することができ、またサンプル、遺伝子、変異の場所による様々な表示、サンプルの絞り込みが行えます。

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル10 QIAGEN DiseaseLand

44 views December 18, 2020

がん以外の疾患を対象にした QIAGEN DiseaseLand では Disease vs. Normal, Responder vs. Non-Responder...

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QIAGEN OmicSoft Land Explorer チュートリアル11 Single Cell Lands

40 views December 18, 2020

Single Cell Land は1細胞レベルの発現情報を集めたLandです。多細胞での発現情報では得られない情報が取得できる場合があります。

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QIAGEN IPA チュートリアル1 初期設定と終了

144 views September 25, 2020

最初に一度だけ必要な最低限必要な初期設定(使用でいるメモリーの最大値の設定)と終了の仕方の説明です。