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QIAGEN IPA チュートリアル1 初期設定と終了

43 views September 25, 2020

最初に一度だけ必要な最低限必要な初期設定(使用でいるメモリーの最大値の設定)と終了の仕方の説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル2 入力データの準備

44 views September 23, 2020

入力データの形式、IPAで用意されているサンプルデータを利用する方法についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル3 テキストデータをエクセルに変換するときの注意点

30 views September 25, 2020

遺伝子名(Gene Symbol) にはSEPT7等、日付に似た名前があります。遺伝子名が入ったデータをエクセルに変換するときには注意が必要です。

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QIAGEN IPA チュートリアル4 データアップロード

25 views September 25, 2020

IPAにデータをアップロードする際、Excel形式でもアップロードできますが、ネットワークの負荷を減らすためタブ区切りのテキスト形式にしてアップロードするとアップ

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QIAGEN IPA チュートリアル5 コアー解析の設定と実行

35 views September 25, 2020

IPAの主要な解析のセットであるコアー解析の設定、実行についての説明です。

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QIAGEN IPA チュートリアル6 コアー解析の結果のまとめ

26 views September 25, 2020

"コアー解析実行結果のまとめ(Summary)についての説明です。 "

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QIAGEN IPA チュートリアル7 既知のパスウエイ(Canonical Pathway)解析

30 views September 25, 2020

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivity Plot...

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QIAGEN IPA チュートリアル8 上流制御因子の解析

22 views September 25, 2020

コアー解析の中でも使用される頻度の高い上流制御因子の解析です。

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QIAGEN IPA チュートリアル9 更なる上流因子の解析

20 views September 25, 2020

上流因子の更に上流の、マスター制御因子となっているかもしれない因子の解析(Causal networks)です。

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QIAGEN IPA チュートリアル10 下流解析

31 views September 25, 2020

下流解析(疾患、機能の解析)です。最初に下流の影響が四角形のヒートマップで表示されます。

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QIAGEN IPA チュートリアル11 Regulator Effects

19 views September 25, 2020

上流と下流を矛盾が少ないように繋いだネットワーク Regulator Effects です。薬剤の新たな疾患の治療薬候補が見つかるかもしれません。

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QIAGEN IPAチュートリアル12 実験結果の類似性検索 Analysis Match

20 views September 25, 2020

IPAには約65,000の差解析を行った実験結果のコアー解析を行っています。Analysis Match により、自分の実験結果と類似した実験を探索することができます。